মগরা নদীর প্রায় ৪০০ বর্গমাইল (৬৪৩ বর্গ কিঃমিঃ) অববাহিকা রয়েছে। এই দীর্ঘ পথের সাথে খরিয়া নদীর মাধ্যমে পুরাতন ব্রহ্মপুত্রের সংযোগ রয়েছে,তবে নেত্রকোনা জেলায় “বূড়বুড়িয়া বিল” এ নদীর অন্যতম উৎস ।এখান থেকে রাংশা নদী ও গজারিয়া নদীর মিলিত স্রোত ধলাই নদী নামে উওর দিকে ঢাকুয়া খালে পতিত হয়েছে ।ধলাই নদী ও ঢাকুয়া খালের মিলিত স্রোত মগরা নামে নেত্রকোনা জেলার পূর্বধলা থানার পাশ দিয়ে প্রবাহিত হয়েছে।

কিশোরগঞ্জের ইটনা থানার প্রবেশের পূর্বে মগরা নদীর সাথে আরো নদীর স্রোতধারার মিলন ঘটেছে এবং সর্বশেষে মদন থানার প্রান্ত ছুঁয়ে ইটনার গন্দ্ববপুর গ্রামের নিকট ধনুতে পড়েছে। মগরা নদীর মোট দৈর্ঘ্য প্রায় ৭৯ মাইল (প্রায় ১২৭ কিঃমিঃ) । তার ভিতর রাংশা নামে প্রায় ১৬ মাইল (প্রায় ২৫ কিঃমিঃ),ধলাই নামে প্রায় ১১ মাইল (প্রায় ১৮কিঃমিঃ)এবং মগরা নামে প্রায় ৫২ মাইল (প্রায় ৮৩ কিঃমিঃ) বর্ষাকালে নাব্য থাকে ।