পাকুন্দিয়া উপজেলার আয়তন ১৮০.৫২ বর্গ কিলোমিটার এবং লোকসংখ্যা ২,৩৫,৯০০ জন। এখানে থানা সদর প্রতিষ্ঠিত হয় ২১ জানুয়ারি ১৯২২ সালে।একটি জনশ্রুতি হচ্ছে, মধ্যযুগে মলং শাহ্ নামে একজন ধর্ম প্রচারক এখানে এসেছিলেন।এই মলং শাহ্’র পাক দেহ থেকে উর্দুতে পাকওয়ান অর্থাৎ পাকানদেহ হতে উচ্চারণ বিবর্তনে পাকুন্দিয়া রূপ নিয়েছে। পণ্ডিত সুকুমার সেনের মতে, পাকুন অর্থ পাকুর গাছ, দিয়া অর্থ দু’পাশের নদী বা খাল বেষ্টিত উঁচু টিলাযুক্ত স্থান। এখানে পাকুর+দিয়া- এ দু’টি শব্দ মিলিয়ে অর্থ দাঁড়ায় দু’টি নদী বা খাল বেষ্টিত উঁচু টিলাযুক্ত স্থানে পাকুর গাছের বন। মূল শব্দটি পাকুর থেকে উচ্চারণ বিবর্তনে পাকুন তার সাথে দিয়া যোগ হয়ে পাকুন্দিয়া হয়েছে।